24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0930 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  76.15 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  61.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  57.94 
 
 		 112 aa  126  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  55.14 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  54.21 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  55.88 
 
 		 112 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  54.9 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  57.84 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  55.88 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  50.94 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  49.04 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  55.14 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  47.17 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  48.04 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  56.41 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  52.43 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  27.66 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 107 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
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