23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3135 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  76.15 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  58.93 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  55.86 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  55.56 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  57.28 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  53.57 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  56.86 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  56.19 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  51.79 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  52.88 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  50.93 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  56.76 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  46.36 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  49.02 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  52.73 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  46.32 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.11 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
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NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
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