22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2205 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  74.04 
 
 		 119 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  58.33 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  57.28 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  57.84 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  57.41 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  55.77 
 
 		 112 aa  127  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  58.25 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  55.56 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  60.36 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  55.88 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  53.92 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  47.66 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  53.01 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  44.86 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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