29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0933 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  79.46 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  67.57 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  62.62 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  60.19 
 
 		 106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  65.69 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  61.17 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  60.19 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  57.28 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  57.94 
 
 		 111 aa  126  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  55.86 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  54.37 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  51.85 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  50.93 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  55.86 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  54.72 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  28.16 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 110 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  25.84 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  38.96 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>