17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1557 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  79.28 
 
 		 120 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  56.86 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  50.93 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  53.4 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  51.46 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  52.43 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  48.48 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  49.02 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  48.04 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  47.57 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  44.86 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  47.17 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>