31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0924 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  220  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  94.64 
 
 		 112 aa  211  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  67.57 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  58.88 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  57.55 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  58.25 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  59.05 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  55.14 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  63.96 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  54.37 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  53.57 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  58.89 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  46.73 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  52.83 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  26.92 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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