24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3313 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  74.04 
 
 		 108 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  61.9 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  60.19 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  57.55 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  55.34 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  57.41 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  62.62 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  56.19 
 
 		 117 aa  113  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  57.84 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  53.4 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  51.43 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  56.88 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  47.57 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  53.09 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 121 aa  48.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30.43 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  26.8 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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