26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1451 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  79.46 
 
 		 112 aa  183  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  63.96 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  63.06 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  60.75 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  56.76 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  54.55 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  56.88 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  55.14 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  56.31 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  53.4 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  50.93 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  55.86 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  51.89 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
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NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  28.42 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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