33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4620 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  94.64 
 
 		 112 aa  211  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  58.88 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  57.41 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  54.37 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  63.06 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  54.21 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  51.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  49.51 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  57.78 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  52.83 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.75 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  26.92 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 113 aa  40  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
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