11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0181 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0181  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.152523 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  31.13 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  33.98 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  40.28 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  43.86 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  39.62 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  34.92 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  37.74 
 
 		 310 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  27.17 
 
 		 335 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  35 
 
 		 303 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>