16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0572 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  100 
 
 		 344 aa  663    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  36.62 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  36.71 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  25.52 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  41.54 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  35.94 
 
 		 169 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  35.9 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  31.07 
 
 		 114 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0034  hypothetical protein  33.87 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  30.77 
 
 		 1394 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  37.74 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2104  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>