16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1134 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1134  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  34.21 
 
 		 453 aa  52  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  34.86 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  45.61 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 453 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 452 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  32.74 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  33.82 
 
 		 529 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 453 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.74 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0584  transcriptional regulator, TrmB  26.29 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000506573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.86 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1933  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.65 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0570892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.7 
 
 		 305 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.73 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>