More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0883 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  319  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  35.05 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 296 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 233 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  30.56 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  33.65 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.53 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  29.52 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  28.1 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 212 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>