More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1972 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  46.58 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  45.39 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  40.29 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  36.46 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.25 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  32.86 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.99 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.07 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.39 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  28.33 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>