215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6003 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  477  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 194 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 169 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  36.88 
 
 		 169 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  32.58 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 151 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.65 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 170 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  35.63 
 
 		 142 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 176 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  53.06 
 
 		 159 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  35.16 
 
 		 292 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 159 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 167 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 149 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  28.26 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 136 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 135 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  31.03 
 
 		 153 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 153 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 145 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 160 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 160 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 142 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 147 aa  48.9  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 151 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 161 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 167 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  24.8 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  38.27 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  50 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.43 
 
 		 172 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  40.43 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 147 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 149 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 158 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 153 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  36.84 
 
 		 146 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>