253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3834 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  40.12 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  41.89 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.06 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.56 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  30.58 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  30.58 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  32.04 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.68 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2841  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 172 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  29.69 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.62 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 303 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37.36 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  24.37 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.04 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  31.07 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.1 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  31.07 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.07 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.07 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.07 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.07 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.17 
 
 		 292 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>