102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3891 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  25.86 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  22.9 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  23.65 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2045  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  24.6 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  25.64 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 180 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 141 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  33.33 
 
 		 147 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 141 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  24.07 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  23.01 
 
 		 166 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  23.86 
 
 		 151 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  32 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  26.98 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  24.73 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  26.14 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 171 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  25.2 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  32.08 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  25 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>