More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2841 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2841  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 164 aa  113  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  42 
 
 		 287 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  40.78 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.27 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  39.08 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.45 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.94 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.61 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.82 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.86 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.27 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  27.34 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  27.34 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  27.34 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.71 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  27.34 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  27.34 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.64 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  34.02 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.19 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.58 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  31.76 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.07 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  27.07 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  26.56 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>