More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2538 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  50.36 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  54.62 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  53.79 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  49.23 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.35 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.17 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.04 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.68 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  34.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 244 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  36.36 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  35.35 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>