More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6031 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  50.38 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  52.42 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 172 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.69 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 315 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  32.52 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  33.04 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>