160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0259 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  294  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  26.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  34.65 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  22.54 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  28.45 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  28.68 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  29.55 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.81 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  26.19 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.25 
 
 		 304 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 304 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  28.12 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  24.32 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.14 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>