More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5701 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  42.31 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 151 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 157 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 151 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 150 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 158 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 315 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.43 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>