More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  321  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  43.62 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  47.22 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  35.16 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.01 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  31.1 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4641  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  33.6 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>