More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0283 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  303  8.000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 172 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.62 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 315 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.96 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.12 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  35.07 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  43.81 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  36.57 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>