More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3114 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 186 aa  349  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 143 aa  94.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  51.02 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  46.79 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  38.58 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  34.64 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  41.9 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  43.04 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  36.79 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  40.95 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  45.56 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  47.13 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  42.53 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  45.98 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  43.18 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  45.68 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.17 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  45.88 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>