247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0968 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  46.51 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  42.58 
 
 		 184 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  41.72 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 168 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  40 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  40.2 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  35.61 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  33.11 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 158 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.82 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 136 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 146 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.55 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.55 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.55 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.55 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.55 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.55 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  33.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  35 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  36 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.67 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  37.93 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  30.21 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.58 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>