124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2662 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 152 aa  288  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  49.64 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  50.51 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  32.37 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  37.96 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.81 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  38.14 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  41.38 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  38.89 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 411 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 163 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 156 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  45.76 
 
 		 165 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.73 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 168 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>