More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3128 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  90.86 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  52.26 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  45.04 
 
 		 148 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 157 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 157 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  45.45 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 175 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  39.31 
 
 		 162 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.88 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  31.62 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  36.04 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  43.94 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.08 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  29.32 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  31.76 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  42.65 
 
 		 158 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  41.56 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 149 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 146 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.67 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.24 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>