219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  301  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  45.64 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  38.64 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  37.42 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.26 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  28.78 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  54 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.68 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  32.09 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.76 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  27.48 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  29.9 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  52.27 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  31.46 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 411 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  33.77 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.34 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.34 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.34 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  31.46 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  55.77 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.34 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>