162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3830 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
172 aa  345  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  80.62 
 
 
168 aa  263  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 
183 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  36.84 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  41.72 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  39.74 
 
 
180 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 
165 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  41.67 
 
 
197 aa  91.3  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  32.89 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  35.4 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  30.77 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
152 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
154 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  29.46 
 
 
169 aa  50.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
142 aa  50.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  33.33 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  25.36 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
136 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  36.78 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
154 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  23.93 
 
 
146 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  35.04 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.39 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  40.38 
 
 
204 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.59 
 
 
138 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 
157 aa  44.3  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  33.87 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  26.44 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>