172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1841 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 148 aa  285  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  36.03 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  38.75 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  48.44 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  41.49 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  46.77 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.66 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  48.89 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  30.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  27.17 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  37.89 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 177 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  41.94 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>