93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3813 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  335  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  72.5 
 
 
176 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  44.12 
 
 
158 aa  84  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  34.06 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  36.97 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  34.11 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  39.66 
 
 
204 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  34 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
203 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  35.78 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  33.87 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
189 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
185 aa  47.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  32.18 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.15 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  47.92 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  29.1 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  27.34 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  31.31 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
171 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
139 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
181 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
162 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  44.44 
 
 
180 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.56 
 
 
139 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
173 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
162 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  28.28 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.69 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  43.75 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  46.81 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
162 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
146 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  25.47 
 
 
149 aa  40.8  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>