86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  100 
 
 		 180 aa  355  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  51.95 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  46.78 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  36.22 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  32.69 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  38.16 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.56 
 
 		 320 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 202 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  41.18 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  33.85 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.86 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  33.85 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  32.98 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 159 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 167 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  30.3 
 
 		 146 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 147 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>