More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3355 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  345  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  90.86 
 
 		 204 aa  290  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  49.68 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  46.56 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  42.42 
 
 		 147 aa  95.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  37.93 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.88 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  32.35 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  45.45 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.23 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 140 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.8 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  27.42 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  41.1 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.11 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>