183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2959 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  74 
 
 		 151 aa  236  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 155 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  29.85 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  33.11 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  27.7 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  48.33 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  28.8 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  21.74 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.61 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  49.02 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  28.24 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  24.24 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>