231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3332 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  52.26 
 
 		 204 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  44.44 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  42.99 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  36.21 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  35.77 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  37.38 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  29.61 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  32.73 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  37.5 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.93 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>