274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3470 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  100 
 
 
147 aa  286  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  51.4 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  43.51 
 
 
141 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  45.45 
 
 
204 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.85 
 
 
162 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  35.2 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  34.38 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.05 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  38.89 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
169 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  38.95 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  36.7 
 
 
197 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
189 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  30.56 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
154 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  29.37 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  37.23 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  39.13 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
185 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  31.4 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.41 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  31.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  32.31 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  35.16 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  28.7 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.71 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  35.16 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  26.88 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
181 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  35.29 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
167 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
165 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
160 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
142 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 
174 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
185 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>