179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0643 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  310  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  74 
 
 		 151 aa  236  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  42.61 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  30.47 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  31.25 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  30.63 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.63 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.82 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  18.98 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  27.64 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  36.99 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  32.56 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>