More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2878 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  76.87 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  55.77 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  52.9 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  26.19 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  33.09 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  23.84 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.17 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  26.24 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  28.12 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.51 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  25 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>