291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4278 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  81.37 
 
 		 164 aa  254  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  75.57 
 
 		 178 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.77 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  41.61 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  42.34 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 144 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 150 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 		 150 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 146 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  41.54 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 140 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 155 aa  90.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  90.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 146 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 140 aa  88.6  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 152 aa  87.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 145 aa  85.9  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.51 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.51 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  36.51 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.51 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.1 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  38.1 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.05 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  29.69 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.97 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  36.28 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  35.16 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.27 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 134 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>