More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2262 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  100 
 
 
145 aa  293  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  100 
 
 
145 aa  293  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  99.31 
 
 
145 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  99.31 
 
 
145 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  99.31 
 
 
145 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  99.31 
 
 
145 aa  289  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  96.55 
 
 
145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  83.45 
 
 
146 aa  246  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  83.45 
 
 
155 aa  246  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  82.76 
 
 
148 aa  245  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  82.76 
 
 
155 aa  244  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  81.94 
 
 
146 aa  240  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  81.94 
 
 
155 aa  239  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  81.94 
 
 
155 aa  239  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  48.59 
 
 
154 aa  137  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  48.59 
 
 
154 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 
144 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  47.86 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  48.55 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.55 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  46.04 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.04 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  46.04 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.04 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
151 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
148 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  44.78 
 
 
140 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 
150 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
163 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.98 
 
 
157 aa  96.7  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 
167 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
179 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  38.4 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
184 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  40 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  25.93 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.91 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
153 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
149 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  29.59 
 
 
179 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
172 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
177 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
159 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
173 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 
195 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  30.97 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  20.29 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
161 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>