More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4194 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  320  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  63.19 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
150 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
174 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
146 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
148 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.64 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.64 
 
 
145 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.64 
 
 
145 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.64 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  49.64 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  49.64 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  49.64 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
155 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  46.56 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 
144 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.55 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  39.55 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
140 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  43.48 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  36.62 
 
 
148 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.62 
 
 
148 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.62 
 
 
148 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
163 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.36 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  38.84 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  39.2 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
144 aa  84.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.46 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.46 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.46 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.46 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.46 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.2 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  27.82 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  33.33 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 
141 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
185 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
161 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  31.68 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
178 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  32.69 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.04 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  28.1 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>