More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4375 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  294  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  95.17 
 
 
146 aa  277  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  95.17 
 
 
155 aa  277  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  94.48 
 
 
155 aa  273  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  92.36 
 
 
146 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  92.36 
 
 
155 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  92.36 
 
 
155 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  83.45 
 
 
145 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  83.45 
 
 
145 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  83.45 
 
 
145 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  83.45 
 
 
145 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  82.76 
 
 
145 aa  245  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  82.76 
 
 
145 aa  245  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  82.07 
 
 
145 aa  244  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  52.82 
 
 
144 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 
154 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  47.89 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  49.28 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.28 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 
151 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  46.04 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.04 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.04 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  46.04 
 
 
165 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
158 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 
150 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
140 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  49.15 
 
 
146 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  41.91 
 
 
140 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
167 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.17 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
154 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
184 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  36 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  35.25 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  34.52 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.93 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  33.63 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  25.83 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.35 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  35.24 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  33.7 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>