More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2624 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  336  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  336  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 
151 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
160 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 
146 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
141 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  29.41 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
163 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
153 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
171 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  32.26 
 
 
158 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
147 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.23 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  32.32 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  27.91 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  30 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
148 aa  50.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
155 aa  50.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  26.8 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  32.43 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>