More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0562 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 165 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  69.13 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  69.74 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 144 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 		 150 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  43.66 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  38.24 
 
 		 149 aa  98.2  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 148 aa  91.3  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  33.78 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  31.54 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  31.19 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  27.13 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.65 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.65 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.52 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.46 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 154 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>