202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4157 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  87.99 
 
 
308 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 
307 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  46.31 
 
 
314 aa  261  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 
305 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  48.82 
 
 
326 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
314 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.11 
 
 
304 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  43.73 
 
 
315 aa  241  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.93 
 
 
312 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  43.83 
 
 
308 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.61 
 
 
310 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
309 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.05 
 
 
320 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
309 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
299 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
310 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.91 
 
 
305 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.9 
 
 
305 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.83 
 
 
322 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.34 
 
 
317 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  35.1 
 
 
318 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
162 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
163 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
143 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
161 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  33.76 
 
 
161 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
161 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.45 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.29 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.47 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
326 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.18 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.92 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.94 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  23.76 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  31.3 
 
 
142 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  23.49 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.44 
 
 
848 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
349 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.23 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
157 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
162 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  34.57 
 
 
159 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
162 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
150 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
162 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 
151 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  23.73 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  21.75 
 
 
352 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  36.25 
 
 
160 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  24.22 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  23.32 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  45.31 
 
 
147 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  21.76 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
172 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
163 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  21.76 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
148 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
162 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
163 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.03 
 
 
149 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
149 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
138 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
168 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  30.5 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
161 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>