156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3554 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  37.27 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  37.63 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
148 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  32.11 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.26 
 
 
158 aa  58.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.05 
 
 
162 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  32.12 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
155 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
185 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  26.97 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
136 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.58 
 
 
145 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.58 
 
 
145 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
158 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
148 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
137 aa  48.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0079  hypothetical protein  29.91 
 
 
156 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  25.58 
 
 
145 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.58 
 
 
145 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  27.36 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  25.58 
 
 
145 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.58 
 
 
145 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  25.58 
 
 
145 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 
162 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  34.29 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  28.21 
 
 
185 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  26.17 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
155 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
158 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.51 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  28.24 
 
 
92 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  23.77 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
164 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
155 aa  44.7  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.31 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  48.78 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  51.22 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>