More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0945 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
161 aa  323  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  30.1 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  29.82 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
183 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  33.88 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  31.47 
 
 
166 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  44.62 
 
 
174 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
166 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
177 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  43.14 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  31.19 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  30.83 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.9 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  26.5 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  28.95 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  30.16 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.96 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  29.47 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.85 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  29.63 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>