269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3523 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  43.06 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  31.58 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  30.17 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  33.11 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  21.8 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.18 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  30.16 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  31 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  31 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  31 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>