More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2740 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  345  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  33.33 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.69 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  26.11 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.39 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
171 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
159 aa  57.4  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  28.76 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  30.56 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  25.19 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.28 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
186 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  26.25 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
304 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
175 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
183 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
146 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.47 
 
 
137 aa  50.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  29.75 
 
 
146 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>